太平天国运动爆发出来的时候，那时的清朝执行的还是以前康熙帝制定出来的军事制度。在这套军事制度制定出来以后，康熙时期以及乾隆时期都得到了很不错的实行效果，值得让人称赞。不过到了一八五零年之后，以前的军事制度已经不能适用了，就和缺少了发条或者是其他重要的零部件的时钟，就算外表看上去再怎么精湛，也已经很难再继续运行下去了。康熙帝定下的军事制度最根本的目的是为了维护大清王朝的统治，避免出现各省的官员相互勾结谋算来跟朝廷进行对抗，并且只会听从皇帝的指令。而到了清朝的后期，国家的军队实力愈发地落后，而这套军事制度也并不再有什么好的作用，反而还是导致清军落后的最根本的原因，那这是为什么呢？
清军到了乾隆时期的时候就已经开始没有发展了，军队里面没有增加过或者说引进过新的装备，士兵们也是没有进行足够的训练，军规军纪方面也是非常的松懈，并不严密，那自然也就谈不上有什么军队的士气以及凝聚力了。所以当遇到了真正的危机以后根本就毫无办法，比如一八四零年爆发的鸦片战争，还有一八五一年爆发的太平天国农民起义运动，参战的是十八支汉人军队以及各支满族驻军，从战争的过程还有结局也能看出这些军队都没有足够的战斗力。
不过从另一种角度去看的话康熙帝精心制定出来的军事制度的目的确实在某一方面得到了实现，那就是全国各地的力量确实没有进行一个结合，根本就不可能凝聚起来。想必这也是康熙帝意想不到的局面，虽然说想要保护好自己的皇权，不过在面对内乱还有外患的时候，不管是汉人的绿营军队还是满人的八旗军队，全部都是各自为战，凝聚在一起一致对敌那时不可能出现的局面，这无疑会造成非常严重的后果。
那时的清朝的正规军有两种组织形式，一种是由满族的八旗组成的八旗军，是一种兵民合一的社会组织制度，还有一种就是由汉人组成的绿营军。这两类正规军当中八旗军是清朝军事力量的核心所在。建立八旗军的是努尔哈赤，八旗分别是正黄，镶黄，正白，镶白，正红，镶红，正蓝，镶蓝，每一旗都设了3名都统，满洲都统、汉军都统还有蒙古都统。在清军入住中原以后，他们发现凭借满人并不多的数量跟庞大的汉人群里比起来不太好保证自己的统治地位，所以便决定要令满人成为世袭的军人阶层，由国家来进行供养，并且也还有规定禁止满汉之间进行通婚还有经济上的竞争。
因为不是所有的满人都会上战场行军打仗，并且也是世袭的，他们也就不再担心自己会被淘汰出军队，而且除了到了能够服兵役的年龄的满族男子要做好出征的准备意外，在训练方面也就变得更加懈怠了，平常没有战事发生的时候，显得无所事事，长此以往下来也就让原本让原本在马上驰骋沙场的彪悍民族逐渐地丧失了他们的锐气。所以在国家遇到了危难，皇权受到了威胁的时候，一直看重的八旗军已经在奢靡的生活当中丧失了本有的战斗力，并不能挽救清朝面临的危机。
满人制定下来的政策是要把全部的兵力都集中在北京周边，再派遣出一些规模数量相对较小的军队驻守在全国的各个地方。在每个省驻扎的军队人数不会很多，关键的是守着比较有战略意义的地方，起着一个警戒的作用。有五分之三的八旗军的兵力都驻守在首都所在的那个省份，其他的省份也就只有五分之一左右的样子。排掉云南还有贵州这两个省份，其他的一些省总督驻守的地方都会有士兵驻守，而广西、江西。安徽以及湖南这几个省份是没有满军驻守在那里的。另外，在总督进行管辖的地方满族将军的级别是要比总督的级别高一些的，他们直接听从皇帝的命令，而且他们只有军事权方面的行使，而行使军事权的对象就只有驻守在那里的满军。
汉人组成的绿营军被派遣到全国的十八个省份驻守，统管绿营军的是满族以及汉族的官员，其中主要就是汉族的官员进行管理。绿营军是直接由朝廷设立的兵部进行管理，这么来看这也算是一种政府军，不过被分到了全国十八个省份里去了。每一个绿营军的财政方面都会由所在的那个省份进行相应的提供，是跟其他的军队扯不上关系的，可以说是完全独立的存在。
绿营军的将军叫做提督，提督的地位就相对于是跟巡抚的地位一样了，要是在那里还有总督存在的话，提督便需要听从总督的命令。清朝就是在总督以及满族的将军当中、巡抚还有提督当中将权力进行了分散，很大程度上避免了高层的官员之间相互勾结在一起从而做出对清朝统治者有危害的事情。巡抚从一定的层面上来说可以对提督有一个制约的作用，主要是因为当地军队的供给方面是由巡抚掌握在手中的。总督以及巡抚有着直接的控制权的是自己的护卫队，他们的护卫队里面的人数通常来说不会超过五千人。
绿营军分散在全国各处，基本上每一个县都会有一定的绿营军。而汉人的军队在一定程度上感觉更偏向于警察的工作，而不是什么军事武装力量，这样在出现大的暴动的时候就没有什么办法了。绿营还有一种比较普遍的现象，那就是吃空饷，并且很多的士兵素质都不会很高，遇到了什么紧急状况的时候最有可能出现的就是招兵买马，甚至对于招来的人也不会有什么筛选，十有八九会把土匪也招进来，此外，虽然说很多的地方都会有驻点，不过士兵们一般都会住在自己的家中，有什么特殊的情况出现了才会回到军营里去。即便真的回到军营，他们也并没有接受过专业的训练，再加上装备也不好，完全就没有什么士气可言。
太平天国农民起义的早期阶段，清廷也曾经想要调遣汉军去打仗，很有可能会是一去不回，凶多吉少的，除了进行的一些守城战争，他们可以凭借坚实的城墙稍有信心，在大部分的时候都会仓皇出逃，更别提跟其他的军队展开合作了。
而事实上八旗军则更加软弱，在起义军抵达长江沿岸的时候，在这情况危急的关头，本来应该是八旗军为主力，绿营军进行适当的辅助，在对上敌人的时候根本就体现不出半个世纪前百战劲旅的势头。
最后还是有汉族的文官挺身而出，使用要在地方进行团练的名义组成了一支新的军队，在几乎没有什么别的军队的帮助之下将清朝挽救回来。这位汉族官员就是曾国藩，他所组建的军队就是历史上赫赫有名的湘军，此后又有一支由李鸿章带领的淮军一起捍卫统治，这两支军队也是后来中国近代军队的一个雏形。
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